Movable Typeのテンプレートを何で編集していますか？MT付属の編集画面は使い辛すぎますよね。コードフォーマットも無いのも痛いです。
私も秀丸などのエディタに貼り付けて使っていましたが、Dreamweaverで編集する方法があったのです∀･）
Movable TypeのテンプレートをDreamweaver MX2004で編集する
http://www.mathatelle.com/archives/2004/09/mtdream_weaver.html
Movable Typeバージョン3.2から、default_templatesというディレクトリ内にテンプレートファイルのセットがあります（拡張子は. tmpl）。こちらをDreamweaverで編集し、FTPでアップロード→MTの再構築で新テンプレートが適用されるようです
詳しくは、上記サイトをご覧下さい。写真付きで非常に分かり易いですよ！
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